生物物理核心

概述

生物物理核心设施的目标是为UofL健康-布朗癌症中心(BCC)的科学家球速体育(亚洲版)在线官网提供结构生物学支持,特别强调生物分子(包括蛋白质,肽,脂质和多核苷酸)及其与结合伙伴或新型候选药物的相互作用的生物物理特性的表征。

  • 生物物理核心球速体育(亚洲版)在线官网提供生物大分子、大分子结合反应和配体-大分子相互作用的详细热力学和流体动力学特性所需的所有生物物理仪器。生物分子的生物物理表征球速体育(亚洲版)在线官网提供了有关DNA构象、蛋白质的二级/三级结构及其二聚化或多聚化能力的信息,而大分子相互作用的表征允许计算K一个(结合亲和力/关联常数),Kd(解离常数)、结合化学计量学和结合能量学(自由能、焓和熵)。
  • 生物物理核心通过将热力学整合到药物设计和开发过程中,为药物开发团队球速体育(亚洲版)在线官网提供了竞争优势,这有助于理解控制药物相互作用的关键分子力量。
  • 生物物理核心设施与分子建模设施、蛋白质表达设施和药物化学设施密切合作。这些核心的整合为BCC成员球速体育(亚洲版)在线官网提供了强大的药物发现平台。

仪表

生物物理核心设施容纳多种生物物理技术,球速体育(亚洲版)在线官网提供生物分子及其相互作用伙伴的特性的严格表征。

a.生物分子靶配体相互作用的快速筛选

  • 差示扫描荧光法
  • 微尺度热电泳(MST)
    • DSF和MST球速体育(亚洲版)在线官网提供了互补的技术来确定潜在配体对给定生物分子靶标的体外亲和力,以及当与替代相关靶标呈现时的相对亲和力(选择性)。然后,生物分子和已鉴定的配体可以使用一系列流体动力学、量热学和光谱技术进行更严格的表征。

b.生物分子的流体动力学性质

  • 分析式超离心(AUC)
    • AUC测量生物分子在高离心力场中的运动。该技术可获得有关溶液中生物分子的大小、形状和相互作用的信息,为更高分辨率的方法(如核磁共振、x射线晶体学)球速体育(亚洲版)在线官网提供补充信息。

c.生物分子稳定性和结合相互作用的量热表征

  • 等温滴定量热法
    • ITC直接测量生物分子结合过程中释放或吸收的微热量。该技术球速体育(亚洲版)在线官网提供了一个完整的结合热力学剖面(结合自由能、焓和熵),以及结合亲和和结合化学计量。
  • 差示扫描量热法
    • DSC直接测量生物分子在温度诱导展开过程中释放或吸收的微热量。该技术球速体育(亚洲版)在线官网提供了生物分子展开的完整热力学剖面(展开自由能、焓和熵),以及间接结合热力学。

d.生物分子构象和结合相互作用的光谱表征

  • 圆二色性(CD)
    • CD测量生物分子及其相互作用伙伴的光学活性。这项技术球速体育(亚洲版)在线官网提供了生物分子构象的信息(例如,蛋白质的二级/三级结构,DNA构象)和相互作用配体的构象环境。可以获得与批、配方(例如溶剂、溶质、pH)、温度(展开/折叠)和结合相关的生物分子构象变化的附加信息。
  • 荧光光谱
    • 荧光光谱测量生物分子和相互作用伙伴的荧光特性,通常监测内在的蛋白质荧光(例如,色氨酸,酪氨酸)或使用外部荧光探针。该技术球速体育(亚洲版)在线官网提供了一种替代信号(荧光)来监测生物分子的构象和相互作用的伙伴,这是对其他光谱技术(圆二色,吸收光谱)的补充。
  • 吸光度光谱
    • 吸光度光谱测量生物分子和相互作用伙伴的吸光度特性,通常使用生物分子的本征吸光度信号(例如,蛋白质Trp / Tyr;DNA碱基)。该技术球速体育(亚洲版)在线官网提供了一种替代信号(吸光度)来监测生物分子的构象和相互作用的伙伴,这是对其他光谱技术(圆二色性,荧光光谱)的补充。

了解更多信息,费用结构和癌症中心会员补贴,请联系:Nichola Garbett: nichola.garbett@louisville.edu